No existen Virus en la BIOS, porque es imposible meterse ahi sin que nadie se de cuenta, algunas razones son:
1.- EL sistema esta protegido de la modificacion de la BIOS, por eso cada que arranca realiza verificacion de las sumas de la BIOS, si alguien modifica algo sin duda alguna verian un error del tipo "Bad Checksum BIOS", pues cualqueir dato adicional metido cambiaria el resultado de esta suma apareciendo este error.
2.- La BIOS ademas del programita de Setup, tambien incluye otras cosas, como funciones de inicializacion del hardware (quien halla trabajdo con electronica digital sabra a que me refiero) y funciones Wrapper (las interrupciones del bios) para acceso al hardware de manera transparente, esto aunado con la gran variedad de hardware disponible, hace que cada mapa de memoria de cada bios sea totalmente diferente, por lo que no hay lugar fisico fijo donde se puede poner el codigo sin dañar la informacion actual, este detalle con el de arriba hace que sea muy dificil y poco viable que alguien se ponga a hacer algo asi cuando es mas facil flasear la bios completa y generar un daño similar.
3.- Un virus capaz de hacer lo anterior, es decir burlar la verificacion de integridad, y tener la capacidad de poder anidarse en la BIOS sin modificar funcion algun, sin importar modelo y version del bios y tener capacidad de poder dividirse para colocarse en los especios libres, seria tan grande que no cabria en la memoria sin causar mayores daños.
4.- Es mas facil flashear la bios y obtener resultados similares.
Si existen virus que afectan a la BIOS, valores de configuracion de esta ... etc., pero no existen virus que se alojen en la BIOS, SI tienes virus, definitivamente no esta en el BIOS y en el escenario en que te encuentras no es recomendable actualizar o regrabar el BIOS por que no tienes un sistema estable y esta en riesgo de perder todo el sistema.
Si sopechas de un virus, lo mas recomendable es que borres el disco totalmente (algunos lo llaman erroneamente LLF) realizando llenado de ceros total, te recomedaria que para ello usases el software del fabricante, esto te asegura el borrado de cualquier estructura de datos que exista y con ella la posibilidad de reinplante del virus aunque se encuentre en la memoria.
Tambien he notado que por ahi andan algunos CD.s de instalacion de windows XP y 2k que tienen virus, asi que tambien seria una probabilidad de que tengas una de esos.
Saludos.